Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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