Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TTLL9Q3SXZ7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TTLL9Q3SXZ7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms