Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms