Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NBPF8Q3BBV2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NBPF8Q3BBV2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms