Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRFIP1Q32MZ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms