Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CDO1Q16878 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CDO1Q16878 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CDO1Q16878 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CDO1Q16878 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDO1Q16878 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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