Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL15Q16663 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL15Q16663 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms