Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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LY6EQ16553 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LY6EQ16553 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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LY6EQ16553 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LY6EQ16553 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LY6EQ16553 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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