Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSRP2Q16527 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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