Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIX1Q15475 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIX1Q15475 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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