Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUM3Q15397 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms