Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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