Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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