Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHPRHQ149N8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHPRHQ149N8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
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