Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD4Q14839 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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