Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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