Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZNF235Q14590 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF235Q14590 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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