Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms