Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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COL4A6Q14031 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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COL4A6Q14031 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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COL4A6Q14031 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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