Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SNTA1Q13424 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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SNTA1Q13424 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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SNTA1Q13424 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTA1Q13424 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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