Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGDRQ13258 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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