Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
GRIN2BQ13224 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GRIN2BQ13224 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms