Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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GRIK3Q13003 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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GRIK3Q13003 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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GRIK3Q13003 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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