Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms