Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXF1Q12946 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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