Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTDSPL2Q05D32 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms