Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALD1Q05682 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALD1Q05682 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms