Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBE3AQ05086 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE3AQ05086 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms