Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CD164Q04900 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CD164Q04900 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CD164Q04900 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CD164Q04900 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CD164Q04900 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CD164Q04900 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms