Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CREMQ03060 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CREMQ03060 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CREMQ03060 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CREMQ03060 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CREMQ03060 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CREMQ03060 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CREMQ03060 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CREMQ03060 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CREMQ03060 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms