Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF9Q00978 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms