Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS9P82933 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms