Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASIC1P78348 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms