Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms