Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVS71-1P61550 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms