Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABP4P57796 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABP4P57796 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABP4P57796 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABP4P57796 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABP4P57796 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABP4P57796 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABP4P57796 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CABP4P57796 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABP4P57796 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CABP4P57796 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms