Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP1P56182 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP1P56182 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP1P56182 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP1P56182 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms