Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRPF1P55201 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms