Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMARCA4P51532 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SMARCA4P51532 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms