Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRXP46100 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATRXP46100 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRXP46100 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRXP46100 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms