Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms