Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA1P38398 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms