Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SFTPDP35247 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms