Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC9P31274 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms