Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD10P28358 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms