Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB1P20700 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms