Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CXCL3P19876 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL3P19876 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms