Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT4P19013 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT4P19013 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT4P19013 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT4P19013 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT4P19013 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms