Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2A2P16615 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2A2P16615 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms