Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFTRP13569 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CFTRP13569 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.97
CFTRP13569 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFTRP13569 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms